南松本駅は戦時中、軍需工場の輸送駅として開業した。松本駅の貨物扱いを当駅に移してからは周辺の産業が発展し、中信地区の貨物輸送ターミナルとして活況を呈した。市街地の拡大により通勤通学のお客さまも年々増加している。