JR東日本通票可在JR東日本的72條線路上使用： 特快列車（不包括單間包廂或臥鋪），包括新幹線特快列車；快速列車(不包括臥鋪等。)；區域內列車（不包括“專線列車/專線往返列車”）。JR東日本通票也可用於乘坐伊豆急行線（超景踊子號 ，踊子號 ）、北越急行線（白鷹號 ，行駛於越後湯澤 和直江津 ）和東武日光線（日光 、日光特快 、鬼怒川 和鬼怒川特快列車 ）。

（如果要乘坐上述括弧內注明的車廂或列車，則應在特快列車或普通列車費用的基礎上支付額外費用。在這種情況下，JR東日本通票僅作為普通車票使用。）

注：部分 JR 東日本線路列車也在其它公司的鐵路線上運行。旅客乘坐這些列車在非JR東日本鐵路線上旅行時，必須支付相應的費用，費用按照在這些線路行駛的實際路程計算。請注意 在非JR東日本鐵路線上運行的JR東日本鐵路線列車名稱為：“超級白鳥號”、“白鳥號”、“雷鳥號”、“北越號”、“信濃號”、以及“東海號”。